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Caracterización bioquímica de Bacillus Thuringiensis Serovar Coreanensis 4al1 (t25001) en relación a su actividad hacia células cáncerigenas

Becerra Manrique, Ana María (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá, D.C.Bacteriología y Laboratorio Clínico, 2020-06-02)

Las proteínas parasporina (PS) son sintetizadas en la fase de esporulación de Bacillus thuringiensis (Bt), una bacteria Gram positiva ampliamente estudiada por actividad insecticida debida a sus toxinas altamente específicas ...
Estudio de la cepa de pseudomonas extremaustralis cmpuju 515 como promotora de crecimiento en plantas de tomate

Rodriguez Mirque, Yudi Carolina (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá, Distrito CapitalBacteriología y Laboratorio Clínico, 2019-11)

El tomate (Solanum lycopersicum) es una hortaliza originaria de la región andina en Suramérica, ampliamente distribuida a nivel mundial, genera gran impacto a nivel nutricional y económico gracias a su alto contenido en ...
Estudio de pseudomonas extremaustralis CMPUJ U515, Bacillus Subtilis ATCC 6633 y Bacillus Thuringiensis Kurstaki HD-1 en relación a estrés: Xenobióticos y Glifosfato

Beltrán Duque, María Angie (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.C.Bacteriología y Laboratorio Clínico, 2020-05)

Los xenobióticos son compuestos químicos no son naturales como fertilizantes, pesticidas, tintes, dioxinas, bifenilos policlorados o hidrocarburos poliaromáticos; contaminantes, afectan a los seres vivos porque no hacen ...
Identificación de factores asociados a promoción de crecimiento vegetal en Bacillus Subtilis Atcc 6633 y Pseudomonas Extremaustralis Cmpuj U515 en el modelo de fríjol

Ballesteros Rojas, Yuli Marcela (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.CBacteriología y Laboratorio Clínico, 2018-05-31)

El fríjol (Phaseolus vulgaris) es una planta leguminosa ampliamente difundida por el mundo, de gran impacto nutricional y económico, se destaca por ser una fuente importante de proteínas. Los mayores productores están ...
Identificación de la diversidad de parasporinas de Bacillus thuringiensis en organismos procariotas

Sánchez Murcia, Paola Andrea (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotáBacteriología y Laboratorio Clínico, 2021-09)

Desde hace 21 años se han venido estudiando unas proteínas producidas por Bacillus thuringiensis en su fase de esporulación, denominadas parasporinas (PS), las cuales han demostrado tener un efecto citotóxico sobre las ...
Implementación del modelo para caracterización de Bacillus thuringiensis serovar neoleonensis (T24001) en el contexto de cáncer de cuello uterino

Camero Hernández, Silvia Fernanda (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.C.,Bacteriología y Laboratorio Clínico, 2020)

RESUMEN Varias cepas de la bacteria entomopatógena Bacillus thuringiensis han sido descritas con actividad citotóxica sobre células cancerosas en cultivo in vitro, incluyendo líneas HeLa, MOLT-4, y Jurkat entre otras. ...
Metabolismo de la formamida y su relacion con enzimas de Bacillus thuringiensis

Guiza Contreras, Joulin Tatiana (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotáBacteriología y Laboratorio Clínico, 2021)

Este proyecto pretende establecer los orígenes y metabolismo de la formamida, un compuesto químico derivado del ácido fórmico usado en la industria para la fabricación de plaguicidas, ya que actualmente representa un ...

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Caracterización bioquímica de Bacillus Thuringiensis Serovar Coreanensis 4al1 (t25001) en relación a su actividad hacia células cáncerigenas
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Estupiñán Torres, Sandra Mónica | 2020-06-02

Las proteínas parasporina (PS) son sintetizadas en la fase de esporulación de Bacillus thuringiensis (Bt), una bacteria Gram positiva ampliamente estudiada por actividad insecticida debida a sus toxinas altamente específicas (proteínas Cry). Las PS son una clase de proteínas Cry, y tienen actividad citotóxica y especifica frente a células cancerosas, induciéndoles muerte celular por necrosis o apoptosis, además de poseer baja o nula actividad sobre las células con funcionamiento normal. Se han descrito varias cepas portadoras de actividad anticancerígena: Bt coreanensis, Bt dakota o Bt colmeri. En este trabajo se decidió caracterizar la cepa de Bt coreanensis 4AL1, en relación a posible actividad anticancerígena mediada por PS. Para este fin, se diseñaron oligonucleótidos específicos para cada uno de los grupos de PS (PS1, PS2, PS3, PS4, PS5, y PS6) registrados en Bacillus thuringiensis toxin nomenclature, tanto para identificar la presencia del gen como para su posterior aislamiento. En segunda instancia se estudió la cepa de Bt coreanensis 4AL1, en el contexto de analizar bioinformáticamente sus genomas en la búsqueda de genes codificantes de PS, y su caracterización bioquímica in silico, donde se determinó la presencia de un péptido relacionado con PS2Aa. Finalmente, se utilizó la cepa Bt coreanensis 4AL1, para obtener ADN genómico por método Hot Shot + Tween, la purificación de cristales posiblemente asociados a PS, y su determinación mediante SDS- PAGE, con presencia de una banda de 37 kDa que podría estar asociada a PS2Aa. Este 9 trabajo aporta a la caracterización de cepas de Bt, específicamente en el contexto de la síntesis de PS asociadas a control de cáncer.

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Estudio de la cepa de pseudomonas extremaustralis cmpuju 515 como promotora de crecimiento en plantas de tomate
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Rojas Arias, Adriana Carolina | 2019-11

El tomate (Solanum lycopersicum) es una hortaliza originaria de la región andina en Suramérica, ampliamente distribuida a nivel mundial, genera gran impacto a nivel nutricional y económico gracias a su alto contenido en vitaminas A y C. La alta demanda de esta hortaliza, y el daño generado en el suelo por productos químicos usados para aumentar la producción, tales como aumento de la acidez ó erosión del suelo, entre otras, se ha buscado otras alternativas en fertilización, incluyendo bacterias promotoras de crecimiento vegetal que habitan en la rizósfera de plantas, son ampliamente conocidas por aumentar crecimiento y productividad en cultivos. En este trabajo se evaluó la capacidad de Pseudomonas extremaustralis CMPUJU 515 como bacteria promotora de crecimiento, teniendo en cuenta que en el género Pseudomonas sp. existen diversas especies con dicha capacidad, como P. aeruginosa PAO1 que promueve el crecimiento en plantas de lechuga, frijol, tomate, entre otras. Con este fin se realizaron bioensayos con inóculos de 1x1010 UFC/ml de la bacteria a semillas de tomate previamente desinfectadas, y cultivadas en suelo estéril. Se encontró que P. extremaustralis CMPUJU 515 promueve el desarrollo de las plantas de tomate, evidenciado en fenotipos asociados a raíz, tallo, y área foliar. Se identificaron 1417 proteínas hipotéticas, grupo en el cual se identificaron varias relacionadas con genes nif, ipdc, hisC1 e hisC2, asociados a fijación de nitrógeno y producción de ácido índol acético. Este trabajo es un aporte al uso de microorganismos asociados a ambientes extremos, y su potencial en promoción de crecimiento vegetal.

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Estudio de pseudomonas extremaustralis CMPUJ U515, Bacillus Subtilis ATCC 6633 y Bacillus Thuringiensis Kurstaki HD-1 en relación a estrés: Xenobióticos y Glifosfato
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López Pazos, Silvio Alejandro | 2020-05

Los xenobióticos son compuestos químicos no son naturales como fertilizantes, pesticidas, tintes, dioxinas, bifenilos policlorados o hidrocarburos poliaromáticos; contaminantes, afectan a los seres vivos porque no hacen parte de rutas metabólicas celulares, y son recalcitrantes. En la agricultura se usan xenobióticos como aldrin, dieldrina, endrina, Clordano, Heptacloro-Hexaclorobenceno, glifosato y DDT. Algunos microorganismos capaces de degradar xenobióticos son especies de Pseudomonas y Bacillus con potencial para biodegradación y biorremediación. P. extremaustralis, B. subtilis y B. thuringiensis poseen enzimas de uso biotecnológico. Hasta el 50% de las proteínas de su genoma se consideran hipotéticas de función desconocida, que pueden desempeñar funciones en procesos de adaptación. Este trabajo tiene como objetivo reconocer la posible presencia de proteínas de P. extremaustralis CMPUJ U515, B. subtilis ATCC6633 y B. thuringiensis kurstaki HD-1 que se expresan en condiciones de estrés, incluyendo degradación de xenobióticos. Haciendo uso de tBLASTn (E < 8e-17/ identidad >40% /cobertura >83%) se determinaron enzimas relacionadas con degradación de compuestos xenobióticos, igual que las enzimas glifosato oxidorreductasa o glicina oxidasa involucradas en la vía AMPA y la enzima fosfatasa específica C-P liasa las cuales están asociadas a la capacidad de tomar glifosato como única fuente de carbono o fosforo respectivamente. Las cepas se sometieron a estrés mediado por antibióticos para determinar la posible síntesis de proteínas de choque térmico GroEL/ES identificándose la posible síntesis de GroES (10 kDa). Este trabajo permite comprender mejor mecanismos por los cuales las bacterias se adaptan a ambientes de estrés y permiten identificar su potencial para Biotecnología ambiental.

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Identificación de factores asociados a promoción de crecimiento vegetal en Bacillus Subtilis Atcc 6633 y Pseudomonas Extremaustralis Cmpuj U515 en el modelo de fríjol
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López Pazos, Silvio Alejandro | 2018-05-31

El fríjol (Phaseolus vulgaris) es una planta leguminosa ampliamente difundida por el mundo, de gran impacto nutricional y económico, se destaca por ser una fuente importante de proteínas. Los mayores productores están en Norte América y Europa, y los mayores consumidores se ubican en Latino América. Las bacterias promotoras de crecimiento vegetal representan un grupo que se asocia con las plantas produciendo efectos benéficos por medio de mecanismos directos como la fijación de nitrógeno, o la solubilización de fosfatos, e indirectos como el biocontrol de patógenos. Bacillus subtilis es una bacteria esporuladora, que posee capacidad de promover el crecimiento en diversos cultivos como tomate, maíz, y espinaca entre otros. Pseudomonas aeruginosa es una bacteria Gram negativa que se ha descrito ampliamente para la promoción de crecimiento vegetal. P. extremaustralis es una bacteria psicrofila cuyo genoma ha sido secuenciado, se caracteriza por la producción de biopolímeros, que sería una estrategía para soportar bajas temperaturas. En este trabajo se evaluó la capacidad de B. subtilis ATCC 6633 y P. extremaustralis CMPUJ U515 para la promoción de crecimiento en fríjol. Se determinó que estas bacterias poseen características relacionadas con promoción de crecimiento como solubilización de fosfato, síntesis de la enzima catalasa y motilidad entre otros Cuando se realizaron bioensayos con semillas de fríjol se encontró que B. subtilis ATCC 6633 tiene efecto benéfico sobre la longitud del tallo, mientras que P. extremaustralis CMPUJ U515 favorece el desarrollo de la raíz. Este trabajo es un primer acercamiento del uso de estas bacterias para la cadena productiva del fríjol.

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Identificación de la diversidad de parasporinas de Bacillus thuringiensis en organismos procariotas
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López Pazos, Silvio Alejandro | 2021-09

Desde hace 21 años se han venido estudiando unas proteínas producidas por Bacillus thuringiensis en su fase de esporulación, denominadas parasporinas (PS), las cuales han demostrado tener un efecto citotóxico sobre las células cancerígenas humanas de diversos orígenes, caracterizándose por poseer propiedades entomopatógenas, no son hemolíticas y por presentan una baja o nula citotoxicidad hacia las células sanas. En este trabajo se analizó la diversidad de las PS en genomas procariotas, determinando en ellos sus propiedades bioquímicas, por otra parte se identificaron patentes relacionadas con PS. Las secuencias se analizaron por medio de las herramientas bioinformáticas BLAST-P, ProtParam y la base de datos para patentes THE LENS. Se manejaron 78 genomas de bacterias y 12 de arqueas, los cuales fueron comparados con las secuencias de aminoácidos de las 19 PS experimentalmente determinadas, obteniendo 1404 y 228 proteínas similares a las PS, respectivamente, estas secuencias se filtraron con base en parámetros de cobertura ≥ 60%, el valor E más cercano a 0 y un porcentaje de identidad ≥20%, obteniendo finalmente 16 proteínas de bacterias y 3 de arqueas, encontrando que tienen actividad intracelular, son proteínas estables, hidrófilas y resistentes a cambios repentinos en su estructura física o química. A partir de la búsqueda de patentes se identificó la existencia de dos patentes activas relacionadas con PS. Con este estudio se pudo determinar que los géneros Bacillus, Vibrio, Clostridium y Nanoarchaeum producen proteínas tipo PS y además que a la fecha se cuenta con dos patentes activas asociadas a las mismas.

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Implementación del modelo para caracterización de Bacillus thuringiensis serovar neoleonensis (T24001) en el contexto de cáncer de cuello uterino
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López Pazos, Silvio Alejandro | 2020

RESUMEN Varias cepas de la bacteria entomopatógena Bacillus thuringiensis han sido descritas con actividad citotóxica sobre células cancerosas en cultivo in vitro, incluyendo líneas HeLa, MOLT-4, y Jurkat entre otras. Esta actividad se ha asociado a una clase de proteínas denominadas parasporinas (PS), las cuales pertenecen al grupo de proteínas insecticidas Cry, Estas PS generan apoptosis en células cancerígenas. En este proyecto se implementó un modelo in vitro para cultivo de células de cáncer de cuello uterino, junto con la caracterización de la cepa B. thuringiensis serovar neoleonensis (T24001), que tiene actividad citotóxica contra la línea tumoral de células T de leucemia (MOLT-4). Con esto en mente, la cepa de trabajo se caracterizó por microscopia de luz y de contraste de fases, se le realizó prueba de sensibilidad a antibióticos (ampicilina, tetraciclina y gentamicina), y finalmente se extrajo purificó cristales parasporales de B. thuringiensis serovar neoleonensis (T24001), los cuales se cuantificaron mediante el método de Bradford, luego se determinó presencia de las proteínas correspondientes en electroforesis en gel de poliacrilamida (SDS-PAGE), y poder visualizar la presencia de posibles PS. Para el cultivo de células de cáncer de cuello uterino se usaron las líneas HeLa y SiHa provenientes de tejido tumoral de cáncer de cuello uterino, con el fin de obtener un modelo estable, constante y reproducible, donde se utilizaron viales que contenían las células en medio de congelación (suero fetal bovino + dimetil sulfuro), las cuales se cultivaron en medio DMEM-High y se incubaron a 37°C en atmosfera de CO2. Estas células se observaron desde las 24 horas con microscopio invertido para determinar confluencia celular de 90%, óptima para ensayos de viabilidad celular mediante el ensayo Tripan Blue, encontrando que las células HeLa son más resistentes a la manipulación que las células SiHa, al utilizar concentraciones celulares conocidas desde 5000 células/ml hasta 40000 células/ml en pruebas de cuatro días, que sean útiles para futuros ensayos de 10 citotoxicidad. Este trabajo aporta al área de determinación de PS como posible agente anticancerígeno gracias a su actividad específica contra células tumorales, y su inocuidad hacia células de tejidos sanas.

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Metabolismo de la formamida y su relacion con enzimas de Bacillus thuringiensis
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Estupíñan Torres, Sandra Mónica | 2021

Este proyecto pretende establecer los orígenes y metabolismo de la formamida, un compuesto químico derivado del ácido fórmico usado en la industria para la fabricación de plaguicidas, ya que actualmente representa un riesgo para el medio ambiente debido a su prolongada presencia en el suelo y un tiempo de degradación lento, lo que la hace un compuesto de importancia en áreas de la ciencia como la biorremediación. La formamida ha sido uno de los ingredientes de los pesticidas durante años e incluso a aquellos pesticidas que incluían la formamida en su formulación se les clasifica en un grupo diferenciado de otros plaguicidas químicos (Plaguicidas a base de Formamidinas) (1). La revisión literaria y el uso de herramientas bioinformáticas permitirán comprender las vías de síntesis y degradación de la misma y conocer el origen primigenio de la formamida y su papel en el origen de la vida, teniendo en cuenta los resultados obtenidos se buscará en el genoma de Bacillus thuringiensis un microorganismo ampliamente usado en la creación de biopesticidas; enzimas genética o funcionalmente similares que actúen en procesos de catálisis de la formamida, puesto que se quiere explorar el potencial de este microorganismo en técnicas de biorremediación para eliminar los residuos de formamida dejados por los plaguicidas químicos utilizados en los cultivos. Cabe destacar que Bt ya ha sido utilizado en la degradación de diferentes compuestos entre ellos los metales pesados y otros ingredientes utilizados en los pesticidas químicos (2).

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Caracterización bioquímica de Bacillus Thuringiensis Serovar Coreanensis 4al1 (t25001) en relación a su actividad hacia células cáncerigenas

Estudio de la cepa de pseudomonas extremaustralis cmpuju 515 como promotora de crecimiento en plantas de tomate

Estudio de pseudomonas extremaustralis CMPUJ U515, Bacillus Subtilis ATCC 6633 y Bacillus Thuringiensis Kurstaki HD-1 en relación a estrés: Xenobióticos y Glifosfato

Identificación de factores asociados a promoción de crecimiento vegetal en Bacillus Subtilis Atcc 6633 y Pseudomonas Extremaustralis Cmpuj U515 en el modelo de fríjol

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Caracterización bioquímica de Bacillus Thuringiensis Serovar Coreanensis 4al1 (t25001) en relación a su actividad hacia células cáncerigenas

Estudio de la cepa de pseudomonas extremaustralis cmpuju 515 como promotora de crecimiento en plantas de tomate

Estudio de pseudomonas extremaustralis CMPUJ U515, Bacillus Subtilis ATCC 6633 y Bacillus Thuringiensis Kurstaki HD-1 en relación a estrés: Xenobióticos y Glifosfato

Identificación de factores asociados a promoción de crecimiento vegetal en Bacillus Subtilis Atcc 6633 y Pseudomonas Extremaustralis Cmpuj U515 en el modelo de fríjol

Identificación de la diversidad de parasporinas de Bacillus thuringiensis en organismos procariotas

Implementación del modelo para caracterización de Bacillus thuringiensis serovar neoleonensis (T24001) en el contexto de cáncer de cuello uterino

Metabolismo de la formamida y su relacion con enzimas de Bacillus thuringiensis

Caracterización bioquímica de Bacillus Thuringiensis Serovar Coreanensis 4al1 (t25001) en relación a su actividad hacia células cáncerigenas

Estudio de la cepa de pseudomonas extremaustralis cmpuju 515 como promotora de crecimiento en plantas de tomate

Estudio de pseudomonas extremaustralis CMPUJ U515, Bacillus Subtilis ATCC 6633 y Bacillus Thuringiensis Kurstaki HD-1 en relación a estrés: Xenobióticos y Glifosfato

Identificación de factores asociados a promoción de crecimiento vegetal en Bacillus Subtilis Atcc 6633 y Pseudomonas Extremaustralis Cmpuj U515 en el modelo de fríjol

Identificación de la diversidad de parasporinas de Bacillus thuringiensis en organismos procariotas

Implementación del modelo para caracterización de Bacillus thuringiensis serovar neoleonensis (T24001) en el contexto de cáncer de cuello uterino

Metabolismo de la formamida y su relacion con enzimas de Bacillus thuringiensis