Determinación de la diversidad taxonómica y funcional de hongos a través de metagenómica en isla de recursos y su influencia en la degradación de materia orgánica en ambiente semiárido de la Guajira.

Posada Buitrago, Martha Lucía | 2022-05

Las islas de recursos son arreglos ecológicos representativos de zonas áridas y semiáridas, donde se acumulan nutrientes y materia orgánica en el suelo, creando un microhábitat favorable bajo el dosel de un árbol nodriza. La transformación del carbono en la naturaleza ocurre principalmente por los microorganismos, y esta transformación es mucho mayor bajo el dosel de árboles y arbustos comparada con suelos desnudos de vegetación que se encuentran contiguos a islas de recursos. Dentro de los microorganismos, los hongos ejercen un papel fundamental en el ciclaje del carbono, debido a que producen un conjunto de enzimas que degradan eficientemente la materia orgánica, sin embargo, poco se conoce sobre los grupos taxonómicos que participan en esta dinámica en islas de recursos en los ambientes áridos de la Guajira. Con esto en mente, se planteó conocer la taxonomía de hongos presentes en estos ecosistemas a través de la metagenómica y determinar la abundancia de los genes que están fuertemente relacionados con la degradación de materia orgánica. Para esto se tomaron muestras de suelo de tres árboles nodriza bajo el dosel (V), y suelo desnudo como control (C), en temporada húmeda (W) y seca (D) en la Guajira. Se extrajo el DNA total de cada muestra y se obtuvo el metagenoma por secuenciación. Los datos mostraron la presencia de 8 filos, 25 clases, 62 órdenes, 7 111 familias y 47 géneros de hongos. Se detectaron 9 vías de metabolismo de materia orgánica, las principales relacionadas al metabolismo de carbohidratos, biosíntesis y metabolismo de los glicanos, como también de lípidos, aminoácidos y metabolitos secundarios. El análisis de los genes en ambas temporadas mostró que hubo mayor abundancia de genes en presencia de vegetación, frente al control. La abundancia estuvo relacionada a genes con actividad Glicosil-hidrolasas en más del 60%, los cuales incluyen algunas actividades como: beta-glucosidasas, endoglucanasas, xilosidasas, celulasas, entre otras.

Efecto de los péptidos ll-37 sobre la expresión de proteínas del Quorum sensing en cepas de s. Aureus y s. Epidermidis

Constanza Muñoz, Liliana | 2019

Los derivados del péptido LL- 37, una catelicidina del sistema inmune han sido ampliamente estudiados por sus efectos antimicrobianos; en el presente estudio se evalúa el efecto antibiopelicula de sus derivados LL37- 1 y DLL-37 diseñados por el grupo de investigación REMA sobre la expresión de algunas proteínas del sistema de Quorum sensing, para ello se evaluó la presencia de algunos genes de complejo agr, se tipificó el AIP por medio de PCR convencional y se realizó un análisis de expresión relativa de los genes del sistema por medio de PCR en tiempo real para aislamientos clínicos de S. aureus y S. epidermidis productores de biopelicula. En cada una de las cepas se encontró al menos uno de los genes del complejo, con lo cual se pudo evidenciar la presencia del sistema en todas las cepas estudiadas, en cuanto al efecto de los péptidos sobre su expresión se observan diferentes efectos individuales para cada una de las cepas que las cepas de S. aureus tienen una disminución de la expresión del gen agrA a las 8 y 10 horas con el péptido LL-37 y las cepas de S. epidermidis a la 10 horas con el péptido DLL-37 para el gen agrB.

Efecto del estres producido por la deficiencia de nitrogeno sobre el crecimiento y produccion de Astaxantina y la expresion de genes relacionados con la misma en el cultivo de Haematococcus pluvialis.

Diaz Sanchez, Juan Camilo | 2016

Genes bacterianos involucrados en degradación de Xenobióticos y defensa contra Patógenos en diferentes Microbiomas: una revisión documental.

Posada Buitrago, Martha Lucía | 2021-05-03

El uso inadecuado y excesivo de fertilizantes, insecticidas y demás sustancias empleadas para “mejorar” la calidad de los cultivos y controlar diferentes plagas, han ocasionado pérdidas no solo a nivel económico sino también medioambiental e incluso para la salud humana, ya que las alternativas actuales para el mantenimiento de los suelos y el control de insectos plaga han sido insuficientes. Por ello, es necesario la búsqueda de nuevas alternativas de control biológico ambientalmente sostenibles. El objetivo de este trabajo fue realizar una investigación sobre los genes bacterianos potencialmente involucrados en degradación de xenobióticos y en defensa contra patógenos microbianos, mediante una revisión documental, donde se incluyó literatura científica, bases de datos bibliográficas, entre otras fuentes, con información de entidades nacionales e internacionales sobre el tema objeto de estudio. Se encontró que de un total de 118 genes bacterianos provenientes del microbioma de suelo, plantas e intestino de insectos, y pertenecientes a los filos Proteobacteria y Firmicutes principalmente, 30 tienen la capacidad de degradar xenobióticos y 88 confieren protección contra diferentes patógenos microbianos. Finalmente, se resalta la importancia de explorar nuevas alternativas que contribuyan al desarrollo de un control biológico ambientalmente sostenible.