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Caracterización molecular de bacterias gram positivas del banco de cepas de la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca

Mendez Dimate, Yury Hasbleidy (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.CBacteriología y Laboratorio Clínico, 2018-11)

Actualmente en el cepario la caracterización de las bacterias Gram positivas, se ha llevado a cabo solo por pruebas bioquímicas y microbiológicas, por lo cual el objetivo de este proyecto fue caracterizar a nivel molecular ...
Genotipificación del promotor de CHRDL2 para la búsqueda de variantes potencialmente relacionadas con la etiología del cáncer colorrectal

Roa Torres, Nasly Yurany (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.CBacteriología y Laboratorio Clínico, 2019-01)

El cáncer colorrectal (CCR) es el resultado de la acumulación de alteraciones genéticas y epigenéticas en el genoma de las células de la mucosa del colon que conduce a la transformación de una célula normal a una célula ...
Identificación de polimorfismos en el gen Mieloperoxidasa y su papel en Candidiasis Vulvovaginal recurrente por Candida SPP en pacientes de Bogotá DC

Montoya Estrada, María Paula; Rincón González, Rincón González (Facultad de Ciencias de la SaludBogotáBacteriología y Laboratorio Clínico, 2022-04-08)

La mieloperoxidasa (MPO) es una proteína antimicrobiana presente en los gránulos azurófilos de los neutrófilos, su acción recae cuando se conjuga en el fagosoma con peróxido de hidrógeno, resultando en sustancias tóxicas ...
Influencia de la dieta en la disrupción de la microbiota intestinal canina: Revisión de la literatura

Ariza Amado, Gineth Vanessa; Zapata Narváez, María Angélica (Facultad de Ciencias de la SaludBogotá D.C.Bacteriología y Laboratorio Clínico, 2022-09)

La microbiota intestinal se refiere a un complejo sistema de múltiples microorganismos que favorecen estructural, inmune, nutritiva y metabólicamente la salud y pueden alterarse por factores como: la dieta, infecciones ...
Mejoramiento del cepario de la universidad Colegio Mayor de Cundinamarca mediante la caracterización molecular de la colección de cepas gram negativas

Guzmán Arias, Laura Carolina; Moreno Muñoz, Diego Alejandro (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.CBacteriología y Laboratorio Clínico, 2018)

Los métodos moleculares se han establecido como procedimientos que verifican la identificación fenotípica, cuando se necesita la identidad exacta de un microorganismo. La Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca cuenta con ...
Mejoramiento del Cepario de la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca mediante la caracterización molecular de la colección de cepas gram negativas

Guzmán, Laura Carolina; Arias, Diego Alejandro (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.CBacteriología y Laboratorio Clínico, 2018-05-31)

Los métodos moleculares se han establecido como procedimientos que verifican la identificación fenotípica, cuando se necesita la identidad exacta de un microorganismo. La Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca cuenta con ...
Revisión documental sobre el Microbioma Humano usado en genética forense con enfasis en agresiones Sexuales.

Gómez Fernández., Luz Dary (Universidad Colegio Mayor de CundinamarcaFacultad de Ciencias de la SaludBogotá D.CBacteriología y Laboratorio Clínico, 2021-05-27)

Por medio de la revisión y la actualización de la literatura científica existente sobre el tema, se verifica si la población microbiana de un indiciado y la recuperada en evidencias producto de agresiones sexuales, se ...

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Caracterización molecular de bacterias gram positivas del banco de cepas de la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca
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Consuelo Sánchez, Ligia Consuelo | 2018-11

Actualmente en el cepario la caracterización de las bacterias Gram positivas, se ha llevado a cabo solo por pruebas bioquímicas y microbiológicas, por lo cual el objetivo de este proyecto fue caracterizar a nivel molecular las bacterias Gram positivas del banco de cepas de la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca, utilizando técnicas moleculares. La metodología incluyó la evaluación de las características fenotípicas de las cepas Gram positivas, e identificación bioquímica. Se obtuvo ADN total con el kit “QUICKDNATM Universal Kit – DE ZYMO RESEARCH” Fluidos biológicos y protocolo celular. La amplificación con PCR del producto se evaluó por electroforesis en gel de agarosa 2% con buffer TAE 1X. Los productos obtenidos fueron secuenciados con los primers 16S-8F y 16S-1492R. Los resultados se editaron en el programa Chromas 2.6.5, y se compararon con las que se encuentran en las bases de datos del GenBank del NCBI (USA) con un porcentaje de identidad igual o mayor al 97%. A partir de los resultados se identificaron 7 bacterias Gram positivas, que concuerdan con los datos fenotípicos del cepario y 3 bacterias que presentaron resultados erráticos (<60pb). Con base a los resultados obtenidos, el presente proyecto fortalece el Banco de cepas de la UCMC, posibilitando la participación en diferentes investigaciones u otros escenarios, incidiendo en el reconocimiento de otras universidades e instituciones, con el fin de generar espacios para consolidarla económicamente. Con estos resultados se pretende, registrar las cepas caracterizadas ante el Instituto de Investigación de Recursos Biológicos “Alexander von Humboldt”.

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Genotipificación del promotor de CHRDL2 para la búsqueda de variantes potencialmente relacionadas con la etiología del cáncer colorrectal
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Posada Buitrago, Martha Lucía | 2019-01

El cáncer colorrectal (CCR) es el resultado de la acumulación de alteraciones genéticas y epigenéticas en el genoma de las células de la mucosa del colon que conduce a la transformación de una célula normal a una célula neoplásica. Variantes en la secuencia de ADN de la región promotora podrían desempeñar un papel importante en la regulación de genes favoreciendo con esto la susceptibilidad a la enfermedad. En el presente estudio se empleó la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) con primers específicos y posterior secuenciación de Sanger para la identificación de variantes de baja frecuencia en una región de 595pb del promotor del oncogén CHRDL2 en 45 muestras de biopsias de tejido tumoral procedentes de pacientes diagnosticados con cáncer de colon o recto. La secuenciación de esta región promotora permitió identificar tres polimorfismos de nucleótido único (SNPs): c.-150C<T en 7 muestras, c.-357C<T en 35 muestras y c.-417C<T en 33 muestras. La frecuencia alélica mínima (MAF) reportada en Ensembl determino que estos polimorfismos son frecuentes en la población y por lo tanto no son causa de la patología, lo cual indica que variantes en este fragmento de la región promotora no se relacionan con la etiología del CCR.

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Identificación de polimorfismos en el gen Mieloperoxidasa y su papel en Candidiasis Vulvovaginal recurrente por Candida SPP en pacientes de Bogotá DC
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Cruz Baquero, Claudia Andrea | 2022-04-08

La mieloperoxidasa (MPO) es una proteína antimicrobiana presente en los gránulos azurófilos de los neutrófilos, su acción recae cuando se conjuga en el fagosoma con peróxido de hidrógeno, resultando en sustancias tóxicas para los microorganismos fagocitados (1). Se ha descrito que las infecciones vulvovaginales recurrentes por Candida spp tienen relación con la deficiencia priMaría de MPO, el cual es un trastorno autosómico recesivo (2), que presenta polimorfismos asociados al procesamiento postraduccional defectuoso de la proteína precursora o con errores pretraduccionales (3), por esto, el propósito fue identificar la relación que existe entre dos polimorfismos de la MPO (Y173C y M251T) con una mayor probabilidad de presentar este tipo de infecciones, puesto que este tipo de polimorfismos no han sido estudiados en el país. Frente a la metodología, se realizó una encuesta, donde se recolectaron 27 muestras de mujeres entre 20-45 años, se les realizó cuadro hemático, tinción Wright y tinción de peroxidasa leucocitaria. Se prosiguió con la extracción de ADN utilizando el kit Wizard® Genomic DNA Purification de Promega, luego se realizó la cuantificación del ADN extraído por espectrofotometría en NanoDrop, y la evaluación de la integridad del ADN mediante electroforesis. Por otro lado, se diseñaron los primers haciendo uso de herramientas bioinformáticas para la estandarización de la PCR convencional, posteriormente se usaron enzimas de restricción y se secuenciaron los productos amplificados con el fin de identificar los polimorfismos mencionados previamente.

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Influencia de la dieta en la disrupción de la microbiota intestinal canina: Revisión de la literatura
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Rincón Riveros, Walter Andrés | 2022-09

La microbiota intestinal se refiere a un complejo sistema de múltiples microorganismos que favorecen estructural, inmune, nutritiva y metabólicamente la salud y pueden alterarse por factores como: la dieta, infecciones y uso de antibióticos. Además, la microbiota puede ayudar al establecimiento, la estructura y la actividad funcional en el tracto gastrointestinal- TGI. Actualmente, las croquetas hechas de harinas y distintos carbohidratos se conocen como el tipo de dieta principal en la alimentación del perro, pese a ello surgen las dietas con alimentos netamente crudos a base de cárnicos, vegetales y otras formulaciones para volver al instinto primitivo del lobo. Esta revisión bibliográfica permitió conocer mediante secuenciación del gen ARNr 16S que los taxa bacterianos predominantes en heces de caninos son Bacillota, Actinomycetota, Pseudomonadota, Bacteroidota y Fusobacteria independientemente de la dieta suministrada. También asociados a estados de disbiosis, presentación de infecciones y predisposición a enfermedades como la Diabetes Mellitus, enfermedad intestinal inflamatoria- EII y diarrea aguda no complicada.

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Mejoramiento del cepario de la universidad Colegio Mayor de Cundinamarca mediante la caracterización molecular de la colección de cepas gram negativas
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Sánchez Leal, Sánchez Leal | 2018

Los métodos moleculares se han establecido como procedimientos que verifican la identificación fenotípica, cuando se necesita la identidad exacta de un microorganismo. La Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca cuenta con una colección de 97 bacterias, que reposan en el Laboratorio Central, todas ellas, manejadas de acuerdo con los protocolos internacionales y niveles de bioseguridad descritos por el CDC de Atlanta. Su identificación actualmente está suministrada por fenotipificación con pruebas bioquímicas por medio del Sistema rápido BBL Crystal. El objetivo de este proyecto fue fortalecer la colección de 41 cepas bacterianas Gram negativas, mediante la identificación molecular de las bacterias. La metodología utilizada fue la obtención de ADN total con el Kit: Zymo Research Quick-DNA Universal, la amplificación del producto de la extracción mediante PCR con evaluación por electroforesis en gel de agarosa 2% con Buffer TAE 1X. El producto de PCR fue enviado al centro de investigación CorpoGen, donde fue secuenciado con los primers 16S8F y 16S-1492R y su edición se realizó con el programa Chromas Lite (versión 2.6.5). Las secuencias editadas, fueron comparadas con las bases de datos pertenecientes al GenBank del NCBI (USA) con el algoritmo BLASTn, asumiendo una identidad significativa superior o igual al 97%.Los resultados obtenidos permitieron identificar molecularmente 17 bacterias, 6 de ellas hasta género, y 11 hasta especie. Las 9 bacterias restantes, arrojaron resultados erráticos. A futuro, se espera establecer una nueva base de datos para posterior registro de la Colección.

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Mejoramiento del Cepario de la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca mediante la caracterización molecular de la colección de cepas gram negativas
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Sanchez Leal, Ligia Consuelo | 2018-05-31

Los métodos moleculares se han establecido como procedimientos que verifican la identificación fenotípica, cuando se necesita la identidad exacta de un microorganismo. La Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca cuenta con una colección de 97 bacterias, que reposan en el Laboratorio Central, todas ellas, manejadas de acuerdo con los protocolos internacionales y niveles de bioseguridad descritos por el CDC de Atlanta. Su identificación actualmente está suministrada por fenotipificación con pruebas bioquímicas por medio del Sistema rápido BBL Crystal. El objetivo de este proyecto fue fortalecer la colección de 41 cepas bacterianas Gram negativas, mediante la identificación molecular de las bacterias. La metodología utilizada fue la obtención de ADN total con el Kit: Zymo Research Quick-DNA Universal, la amplificación del producto de la extracción mediante PCR con evaluación por electroforesis en gel de agarosa 2% con Buffer TAE 1X. El producto de PCR fue enviado al centro de investigación CorpoGen, donde fue secuenciado con los primers 16S8F y 16S-1492R y su edición se realizó con el programa Chromas Lite (versión 2.6.5). Las secuencias editadas, fueron comparadas con las bases de datos pertenecientes al GenBank del NCBI (USA) con el algoritmo BLASTn, asumiendo una identidad significativa superior o igual al 97%.Los resultados obtenidos permitieron identificar molecularmente 17 bacterias, 6 de ellas hasta género, y 11 hasta especie. Las 9 bacterias restantes, arrojaron resultados erráticos. A futuro, se espera establecer una nueva base de datos para posterior registro de la Colección

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Revisión documental sobre el Microbioma Humano usado en genética forense con enfasis en agresiones Sexuales.
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Vargas Díaz, Luis Eduardo | 2021-05-27

Por medio de la revisión y la actualización de la literatura científica existente sobre el tema, se verifica si la población microbiana de un indiciado y la recuperada en evidencias producto de agresiones sexuales, se correlacionan, de tal manera que se puedan encontrar hallazgos vinculantes. Próximamente, en el futuro se podrá usar muestras de Microbioma humano recolectadas en una escena del crimen como evidencia para deducir en donde se encontraba un posible sospechoso, el origen étnico de una persona o probar si un ataque sexual se perpetuo, cuando la evidencia de ADN sea insuficiente o nula. Pues el avance en la secuenciación y el surgimiento de técnicas de análisis del ARNr 16S prometen ser los testigos fieles en casos forenses. Como es bien sabido en casi todo lo que nos rodea se pueden encontrar microorganismos (p. Ej., Virus, bacterias y muchos hongos), estableciendo comunidades notablemente diversas y ubicuas. Que benefician al desarrollo de nuevas investigaciones donde sea beneficioso el usar estos microrganismos; de la relación del conocimiento y la experiencia de la microbiología y el análisis forense, nació el análisis forense microbiano o microbiología forense. Esta ciencia emplea métodos microbiológicos para analizar evidencia involucrada en un millar de casos criminales con el objetivo clásico de atribución forense. Por ello nace la idea de que a través del microbioma sea posible analizar y crear perfiles microbianos, para ayudar a resolver casos forenses, en especial los de violencia sexual. Pues las pruebas forenses en donde se usa el ADN desde hace más de 30 años han sido muy importantes en los casos penales y civiles, pues la evidencia de ADN es usada como un testigo invisible para establecer la conectividad de la escena del crimen y los sospechosos o las víctimas. Palabras clave: ARNr 16S, Microbioma humano, Secuenciación, Fluidos corporales, Delito sexual.

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Genotipificación del promotor de CHRDL2 para la búsqueda de variantes potencialmente relacionadas con la etiología del cáncer colorrectal

Identificación de polimorfismos en el gen Mieloperoxidasa y su papel en Candidiasis Vulvovaginal recurrente por Candida SPP en pacientes de Bogotá DC

Influencia de la dieta en la disrupción de la microbiota intestinal canina: Revisión de la literatura

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Genotipificación del promotor de CHRDL2 para la búsqueda de variantes potencialmente relacionadas con la etiología del cáncer colorrectal

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Identificación de polimorfismos en el gen Mieloperoxidasa y su papel en Candidiasis Vulvovaginal recurrente por Candida SPP en pacientes de Bogotá DC

Influencia de la dieta en la disrupción de la microbiota intestinal canina: Revisión de la literatura

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Mejoramiento del Cepario de la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca mediante la caracterización molecular de la colección de cepas gram negativas

Revisión documental sobre el Microbioma Humano usado en genética forense con enfasis en agresiones Sexuales.

Caracterización molecular de bacterias gram positivas del banco de cepas de la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca

Genotipificación del promotor de CHRDL2 para la búsqueda de variantes potencialmente relacionadas con la etiología del cáncer colorrectal

Identificación de polimorfismos en el gen Mieloperoxidasa y su papel en Candidiasis Vulvovaginal recurrente por Candida SPP en pacientes de Bogotá DC

Influencia de la dieta en la disrupción de la microbiota intestinal canina: Revisión de la literatura

Mejoramiento del cepario de la universidad Colegio Mayor de Cundinamarca mediante la caracterización molecular de la colección de cepas gram negativas

Mejoramiento del Cepario de la Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca mediante la caracterización molecular de la colección de cepas gram negativas

Revisión documental sobre el Microbioma Humano usado en genética forense con enfasis en agresiones Sexuales.