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Caracterización IN SILCO de la acción bactericida de la holotricina-3 frente a ESCHERICHIA COLI

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dc.contributor.advisorGonzález Gómez, Andrés Camilo
dc.contributor.advisorParra Muñoz, Diana Marcela
dc.contributor.authorGutiérrez Ovalle, Paula Andrea
dc.date.accessioned2025-11-11T20:37:10Z
dc.date.issued2024-10-11
dc.description.abstractEscherichia coli es una bacteria Gram negativa que se asocia principalmente a enfermedades diarreicas agudas, sin embargo, en los últimos años ha tomado una mayor importancia en salud pública ya que se encuentra en la lista de patógenos prioritarios y críticos del 2024 que publico la Organización mundial de salud (OMS) , esto se debe a que actualmente el número de antibióticos efectivos para tratar infecciones causada por esta bacteria, son escasos. En la búsqueda de tratamientos alternativos para combatir este problema es que surgen los péptidos antimicrobianos (PAM's). La Holotricina-3 es un PAM sintetizado en la hemolinfa del coleóptero Holotrichia diomphalia que hasta el momento ha mostrado tener propiedades fungicidas contra Candida albicans. El objetivo de este estudio fue caracterizar la acción bactericida mediante un acoplamiento molecular por Haddock 2.4 entre Holotricina-3 contra ZipA, FtsA y YidC que son proteínas blanco de E. coli. Los resultados demostraron que el acoplamiento molecular de Holtricina- 3 y FtsA fue el que más interacciones entre residuos tuvo, mientras que el de YidC mostró posiblemente puede inhibir su función como insertasa y finalmente, el que se realizó contra ZipA demostró que interactuaba con los aminoácidos cargados de la proteína lo cual podría desestabilizar su estructura. En conclusión, Holotricina-3 parece tener la capacidad estructural de interactuar con distintos sitios activos gracias a su dominio desordenado y estos resultados puede ser utilizados para llevar a cabo experimentos in vitro.
dc.description.degreelevelPregrado
dc.description.degreenameBacteriólogo(a) y Laboratorista Clínico
dc.description.tableofcontentsTABLA DE CONTENIDO ÍNDICE DE TABLAS.. 10 ÍNDICE DE FIGURAS 11 RESUMEN.. 12 1. INTRODUCCIÓN 14 2. ANTECEDENTES 15 3. OBJETIVOS. 16 3.1. Objetivo general 16 3.2. Objetivos específicos.. 16 4. JUSTIFICACIÓN. 16 5. MARCO TEÓRICO 19 5.1.1. CARACTERÍSTICAS GENERALES DE E. coli 19 5.1.2. Enfermedades causadas por E. coli..22 5.1.2.1. E. coli enterotoxigénica (ETEC)..23 5.1.2.2. E. coli enteropatógena (EPEC).. 23 5.1.2.3. E. coli enterohemorrágica (EHEC) . 24 5.1.2.4. E. coli enteroinvasiva (EIEC).. 25 5.1.2.5. E. coli de adherencia difusa (DAEC).. 26 5.1.2.6. E. coli adherente-invasiva (AIEC)27 5.1.2.7. E. coli enteroagregativa (EAEC) ..28 5.1.3. Proteínas blanco de E. coli . 30 5.1.3.1. ZipA. 30 5.1.3.2. YidC 32 5.1.3.3. FtsA . 33 5.1.4. MECANISMOS DE RESISTENCIA DE E. coli 34 5.1.4.1. Inactivación enzimática .. 34 5.1.4.2. Alteraciones de la permeabilidad .35 5.1.4.3. Modificaciones en el sitio blanco ..35 5.1.4.4. Bombas de flujo 36 5.1.4.5. Resistencia a los betalactámicos 37 5.1.4.6. Resistencia a las quinolonas.38 5.1.4.7. Resistencia a trimetoprim–sulfametoxazol. 39 5.1.4.8. Resistencia al cloramfenicol.39 5.1.4.9. Resistencia a las tetraciclinas.. 40 5.1.5. PÉPTIDOS ANTIMICROBIANOS.. 41 5.1.5.1. Historia.. 41 5.1.5.2. Características generales de los PAM’s42 5.1.5.3. Mecanismo de acción de los péptidos antimicrobianos..43 5.1.6. Holotrichia diomphalia.. 45 5.1.7. HOLOTRICINA-3 46 5.1.7.1. Definición. 46 5.1.7.2. Usos y aplicaciones. 46 5.1.7.3. Secuencia de aminoácidos de Holotricina-3 ..48 5.1.7.4. Estructura tridimensional de la Holotricina-3. 48 6. DISEÑO METODOLÓGICO .. 48 6.1. Búsqueda de secuencias 49 6.1.1. Búsqueda de secuencias de aminoácidos de FtsA, YidC, ZipA . 50 6.1.2. Búsqueda de secuencias aminoácidos Holotricina-3. 50 6.2. Bioinformática descriptiva. 50 6.2.1. Análisis de secuencias de aminoácidos de Holotricina-3. 50 6.2.2. Análisis de ortología de Holotricina-3 50 6.2.3. Análisis de dominios de Holotricina-3 51 6.2.4. Interferencias funcionales de Holotricina-3 ..51 6.3. Análisis de homología de las secuencias de proteínas de E. coli.51 6.4. Estructura tridimensional de proteínas de E. coli y Holotricina51 6.4.1. Modelamiento 3D de FtsA, ZipA, YidC52 6.4.2. Búsqueda de modelos 3D de Holotricina-3. 52 6.5. Identificación de sitios activos de Holotricina-3 y proteínas de E. coli.. 52 6.6. Acoplamiento molecular por Haddock 2.4 .. 52 7. RESULTADOS ..53 7.1.1. Búsqueda de secuencias 53 7.1.1.1. Búsqueda de secuencias de aminoácidos de Holotricina-3, FtsA, YidC y ZipA 7.1.2. Bioinformática descriptiva. 54 7.1.3. Análisis de secuencias Holotricina-3 54 7.1.3.1. Análisis de ortología de Holotricina-3 y posibles inferencias funcionales.. 54 7.1.3.2. Análisis de dominios de Holotricina 54 7.2. Análisis de homología de secuencias de aminoácidos de E. coli .55 7.3. Identificación de sitios activos. 56 8. Acoplamiento molecular..58 8.1.1. Puntuación Haddock 59 8.1.2. Tamaño del clúster o número de estructuras agrupadas.. 60 8.1.3. Energías de Van der Waals, electrostáticas y solvatación. 60 8.1.4. Restricciones violatorias de energía y Área de superficie enterrada . 60 8.1.5. Puntuación Z . 60 9. DISCUSIÓN . 61 10. CONCLUSIONES. 63 11. LIMITACIONE Y RECOMENDACIONES .. 63 12. ANEXOS. 64 13. REFERENCIAS BIBLIOGRÁFICAS.65
dc.format.extent76p.
dc.format.mimetypeapplication/pdf
dc.identifier.urihttps://repositorio.universidadmayor.edu.co/handle/unicolmayor/7258
dc.language.isospa
dc.publisherUniversidad Colegio Mayor de Cundinamarca
dc.publisher.facultyFacultad de Ciencias de la Salud
dc.publisher.placeBogota
dc.publisher.programBacteriología y Laboratorio Clínico
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dc.rights.licenseAtribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)
dc.rights.urihttps://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.subject.proposalPéptidos antimicrobianos
dc.subject.proposalEscherichia coli
dc.subject.proposalAcoplamiento molecular
dc.subject.proposalHaddock 2.4
dc.titleCaracterización IN SILCO de la acción bactericida de la holotricina-3 frente a ESCHERICHIA COLI
dc.typeTrabajo de grado - Pregrado
dc.type.coarhttp://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.coarversionhttp://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
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