Estudio metagenómico de la diversidad eucariota del ecosistema del manglar de la bahía de cispatá, san antero, Córdoba

Abstract

La importancia biológica de los manglares consiste en proteger a un sin fin de organismos en sus raíces, troncos, lodo y agua, donde se encuentran organismos como bacterias y hongos que hacen parte de la descomposición de materiales orgánicos y pueden transformar materiales tóxicos, limpiando el agua que desemboca allí. La metagenómica, es una de las denominadas ciencias ómicas, que compara e intenta reconstruir el metabolismo de un ecosistema completo o el de un microorganismo en específico La metagenómica resulta óptima a la hora de evaluar todos los aspectos relacionados con los microorganismos que no pueden ser cultivados, es por ello que este estudio busca identificar todas las poblaciones eucariontes que lo habitan, destacando características importantes que se dan por la conformación filogenética de los mismos y que resultan en grandes aportes dentro del ciclo biológico del ecosistema. Se obtuvieron muestras de sedimento y de agua, en cuatro zonas específicas del manglar de la Bahía de Cispatá: zona nativa, zona reforestada hace 10 años, zona reforestada hace dos años e intervenida; la región 18S del ADNr fue secuenciado en la plataforma Illumina MiSeq (ZymoResearch, USA), y se obtuvieron 1.302.526 secuencias crudas y finalmente 3.323 Unidades Taxonómicas Operacionales (OTU), donde el filo predominante identificado es Archaeplastida, clasificación donde se encuentran todas las algas verdes, rojas entre otras

Metagenomics, one of the so-called omic sciences, reconstruct the metabolism of a complete ecosystem or specific microorganisms, as in the case of the mangrove swamp of Cispatá Bay. Mangroves biological importance relies on protecting to an endless number of organisms in their roots, trunks, mud and water, where organisms such as bacteria and fungi co-exists. Those organisms are fundamental for decomposition of organic materials, and clearance of toxic materials. Metagenomics is optimal for evaluating all aspects related to microorganisms that can not be cultivated. Hence, this study seeks to identify all the eukaryotic populations that inhabit it, highlighting important characteristics that are given by the phylogenetic conformation and that result in large contributions within the biological cycle of the ecosystem. Samples of sediment and water were obtained in four specific zones of the mangrove: native zone, area reforested 10 years ago, area reforested 2 years ago and intervened. The 18S region of the rDNA was sequenced on the Illumina MiSeq platform (ZymoResearch, USA), 1,302,526 raw sequences were obtained and 3,323 Operational Taxonomic Units (OTU) were determined, where the predominant Phylum identified was Archaeplastida, which contains all the green and red algae, among other taxa.