Las infecciones asociadas a la atención en salud (IAAS) han cobrado relevancia en salud pública a nivel global por la creciente frecuencia de infección en múltiples regiones. Este panorama es aún más crítico en bacterias Gram negativas como Pseudomonas aeruginosa. Esta especie coloniza ambientes hospitalarios y dispositivos médicos (como catéteres y ventiladores mecánicos), generando infecciones crónicas en pacientes, incluyendo con fibrosis quística, infecciones en heridas, entre otras problemáticas de importancia en salud. En el presente estudio, se analizó la arquitectura genómica de 10 aislamientos de Pseudomonas aeruginosa en un hospital de tercer nivel en Bogotá D. C. - Colombia a partir de la secuenciación de genoma completo y la tipificación de secuencias multilocus (MLST) centrándose en su asignación intrataxa diversidad genómica e identificación de 2 perfiles moleculares con descripción de dinámica de transmisión a nivel microgeográfico y global. En este estudio, se evidenció la dispersión por diferentes servicios hospitalarios y periodos de tiempo, también se identificaron seis tipos de secuencia (ST), de los cuales cuatro se asignaron a complejos clonales, mientras que dos ST correspondieron a singletons, al no ser incluidos en ningún grupo clonal. De las secuencias identificadas, ST111 y ST235 han sido previamente reportados en Colombia con alta presencia intrahospitalaria y mientras que ST663, ST357, ST2211, ST1290, ST2148 tienen en otros países, sin embargo, cuatro secuencias no lograron ser clasificadas. Esta investigación pone en manifiesto la necesidad de establecer sistemas de vigilancia basadas en nuevas tecnologías para rastrear la propagación de clones y estudiar la diseminación de Pseudomonas aeruginosa.