Caracterización genómica de aislamientos de pseudomonas aeruginosa Multidrogorresistentes establecidos en un hospital de tercer nivel en Bogotá d.c., Colombia

Picón Moncada, Laura Tatiana; Rincon Riveros,  Andres; Muñoz Díaz, Marina

Publicación:
Caracterización genómica de aislamientos de pseudomonas aeruginosa Multidrogorresistentes establecidos en un hospital de tercer nivel en Bogotá d.c., Colombia

dc.contributor.author	Picón Moncada, Laura Tatiana
dc.contributor.author	Rincon Riveros, Andres
dc.contributor.author	Muñoz Díaz, Marina
dc.date.accessioned	2025-11-06T15:53:08Z
dc.date.issued	2024
dc.description.abstract	Las infecciones asociadas a la atención en salud (IAAS) han cobrado relevancia en salud pública a nivel global por la creciente frecuencia de infección en múltiples regiones. Este panorama es aún más crítico en bacterias Gram negativas como Pseudomonas aeruginosa. Esta especie coloniza ambientes hospitalarios y dispositivos médicos (como catéteres y ventiladores mecánicos), generando infecciones crónicas en pacientes, incluyendo con fibrosis quística, infecciones en heridas, entre otras problemáticas de importancia en salud. En el presente estudio, se analizó la arquitectura genómica de 10 aislamientos de Pseudomonas aeruginosa en un hospital de tercer nivel en Bogotá D. C. - Colombia a partir de la secuenciación de genoma completo y la tipificación de secuencias multilocus (MLST) centrándose en su asignación intrataxa diversidad genómica e identificación de 2 perfiles moleculares con descripción de dinámica de transmisión a nivel microgeográfico y global. En este estudio, se evidenció la dispersión por diferentes servicios hospitalarios y periodos de tiempo, también se identificaron seis tipos de secuencia (ST), de los cuales cuatro se asignaron a complejos clonales, mientras que dos ST correspondieron a singletons, al no ser incluidos en ningún grupo clonal. De las secuencias identificadas, ST111 y ST235 han sido previamente reportados en Colombia con alta presencia intrahospitalaria y mientras que ST663, ST357, ST2211, ST1290, ST2148 tienen en otros países, sin embargo, cuatro secuencias no lograron ser clasificadas. Esta investigación pone en manifiesto la necesidad de establecer sistemas de vigilancia basadas en nuevas tecnologías para rastrear la propagación de clones y estudiar la diseminación de Pseudomonas aeruginosa.
dc.description.degreelevel	Pregrado
dc.description.degreename	Bacteriólogo(a) y Laboratorista Clínico
dc.format.extent	23p.
dc.format.mimetype	application/pdf
dc.identifier.uri	https://repositorio.universidadmayor.edu.co/handle/unicolmayor/7253
dc.publisher	Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca
dc.publisher.faculty	Facultad de Ciencias de la Salud
dc.publisher.place	Bogota
dc.publisher.program	Bacteriología y Laboratorio Clínico
dc.relation.references	Grace A, Sahu R, Owen DR, Dennis VA. Pseudomonas aeruginosa reference strains PAO1 and PA14: A genomic, phenotypic, and therapeutic review. Front Microbiol [Internet]. 2022 Oct 13 [cited 2023 Jan 28];13. Available from:/pmc/articles/PMC9607943/
dc.relation.references	Adelantado Lacasa M, Portillo ME, Lobo Palanco J, Chamorro J, Ezpeleta Baquedano C. Molecular Epidemiology of Multidrug-Resistant Pseudomonas aeruginosa Acquired in a Spanish Intensive Care Unit: Using Diverse Typing Methods to Identify Clonal Types. Microorganisms [Internet]. 2022 Sep 1 [cited 2023 Feb 28];10(9). Available from: /pmc/articles/PMC9502743/
dc.relation.references	WHO bacterial priority pathogens list, 2024: Bacterial pathogens of public health importance to guide research, development and strategies to prevent and control antimicrobial resistance [Internet]. Who.int. World Health Organization; 2024 [cited 15 Oct 2024]. Disponible en: https://www.who.int/publications/i/item/9789240093461?trk=feed- detail_main-feed-card_feed-article-content
dc.relation.references	Pallares Gutiérrez CJ, Esparza G, Quirós RE, Levy G, Lichtenberger P, Benadof D, et al. Consenso latinoamericano sobre la importancia de un sistema de gestión de datos microbiológicos para apoyar el programa de optimización de uso de antimicrobianos (PROA): Recomendaciones basadas en la evidencia. Parte 1. Rev Chilena Infectol [Internet]. 2024 [cited 17 Oct 2024];41(1):36–49. Disponible en: https://mail.revinf.cl/index.php/revinf/article/view/1900
dc.relation.references	Bajire SK, Ghate SD, Shetty S, Banerjee S, Rao RSP, Shetty V, et al. Unveiling the role of hub proteins in controlling quorum sensing regulated virulence through analogues in Pseudomonas aeruginosa PAO1: A functional protein-protein network biology approach. Biochem Biophys Res Commun [Internet]. 2023 Jun 11 [cited 2023 May 22];660:13–20. Available from: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37058843/
dc.relation.references	Grace A, Sahu R, Owen DR, Dennis VA. Pseudomonas aeruginosa reference strains PAO1 and PA14: A genomic, phenotypic, and therapeutic review. Vol. 13, Frontiers in Microbiology. Frontiers Media S.A.; 2022
dc.relation.references	Sawa T, Momiyama K, Mihara T, Kainuma A, Kinoshita M, Moriyama K. Molecular epidemiology of clinically high-risk Pseudomonas aeruginosa strains: Practical overview. Microbiol Immunol [Internet]. 2020;64(5):331–44. Disponible en: http://dx.doi.org/10.1111/1348-0421.12776
dc.relation.references	Karampatakis T, Antachopoulos C, Tsakris A, Roilides E. Molecular epidemiology of carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa in an endemic area: comparison with global data. European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases 2018 37:7 [Internet]. 2018 Apr 11 [cited 2023 May 22];37(7):1211–20. Available from: https://link-springer- com.ezproxy.unicolmayor.edu.co/article/10.1007/s10096-018-3244- 4
dc.relation.references	McAulay K, Schuetz AN, Fauntleroy K, Shen L, Merveille Y-M, Deroncelay A, et al. Multidrug-resistant Pseudomonas aeruginosa in healthcare facilities in Port-au-Prince, Haiti. J Glob Antimicrob Resist [Internet]. 2021;25:60–5. Disponible en: http://dx.doi.org/10.1016/j.jgar.2021.02.016
dc.relation.references	Ozer EA, Allen JP, Hauser AR. Characterization of the core and accessory genomes of Pseudomonas aeruginosa using bioinformatic tools Spine and AGEnt. BMC Genomics [Internet]. 2014 Aug 29 [cited 2023 Apr 15];15(1). Available from: /pmc/articles/PMC4155085/
dc.relation.references	de Sousa T, Hébraud M, Enes Dapkevicius MLN, Maltez L, Pereira JE, Capita R, et al. Genomic and metabolic characteristics of the pathogenicity in pseudomonas aeruginosa. Vol. 22, International Journal of Molecular Sciences. MDPI; 2021. 12. Reyes J, Komarow L, Chen L, Ge L, Hanson BM, Cober E, et al. Global epidemiology and clinical outcomes of carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa and associated carbapenemases (POP): a prospective cohort study. Lancet Microbe [Internet]. 2023 Mar [cited 2023 May 15];4(3):e159–70. Available from: http://www.thelancet.com/article/S2666524722003299/fulltext
dc.relation.references	del Barrio-Tofiño E, López-Causapé C, Oliver A. Pseudomonas aeruginosa epidemic high-risk clones and their association with horizontally-acquired β-lactamases: 2020 update. Int J Antimicrob Agents. 2020 Dec 1;56(6):106196. 15. Fischer S, Dethlefsen S, Klockgether J, Tümmler B. Phenotypic and Genomic Comparison of the Two Most Common ExoU-Positive Pseudomonas aeruginosa Clones, PA14 and ST235. mSystems [Internet]. 2020 Dec 22 [cited 2023 May 22];5(6). Available from: https://journals.asm.org/doi/10.1128/mSystems.01007-20
dc.relation.references	del Barrio-Tofiño E, López-Causapé C, Oliver A. Pseudomonas aeruginosa epidemic high-risk clones and their association with horizontally-acquired β-lactamases: 2020 update. Int J Antimicrob Agents. 2020 Dec 1;56(6):106196. 15. Fischer S, Dethlefsen S, Klockgether J, Tümmler B. Phenotypic and Genomic Comparison of the Two Most Common ExoU-Positive Pseudomonas aeruginosa Clones, PA14 and ST235. mSystems [Internet]. 2020 Dec 22 [cited 2023 May 22];5(6). Available from: https://journals.asm.org/doi/10.1128/mSystems.01007-20
dc.relation.references	Vatansever, Cansel et al. “Co-existence of OXA-48 and NDM-1 in colistin resistant Pseudomonas aeruginosa ST235.” Emerging microbes & infections vol. 9,1 152-154. 21 Jan. 2020, doi:10.1080/22221751.2020.1713025
dc.relation.references	Fischer S, Dethlefsen S, Klockgether J, Tümmler B. Phenotypic and Genomic Comparison of the Two Most Common ExoU-Positive Pseudomonas aeruginosa Clones, PA14 and ST235. mSystems [Internet]. 2020 Dec 22 [cited 2023 May 22];5(6). Available from: https://journals.asm.org/doi/10.1128/mSystems.01007-20
dc.relation.references	Hu Y, Qing Y, Chen J, Liu C, Lu J, Wang Q, et al. Prevalence, Risk Factors, and Molecular Epidemiology of Intestinal Carbapenem-Resistant Pseudomonas aeruginosa. Microbiol Spectr [Internet]. 2021 Dec 22 [cited 2023 May 15];9(3). Available from: /pmc/articles/PMC8612150/
dc.relation.references	Treepong P, Kos VN, Guyeux C, Blanc DS, Bertrand X, Valot B, et al. Global emergence of the widespread Pseudomonas aeruginosa ST235 clone. Clinical Microbiology and Infection. 2018 Mar 1;24(3):258–66.
dc.relation.references	Irum S, Naz K, Ullah N, Mustafa Z, Ali A, Arslan M, Khalid K, Andleeb S. Antimicrobial Resistance and Genomic Characterization of Six New Sequence Types in Multidrug- Resistant Pseudomonas aeruginosa Clinical Isolates from Pakistan. Antibiotics (Basel). 2021 Nov 12;10(11):1386. doi: 10.3390/antibiotics10111386. PMID: 34827324; PMCID: PMC8615273.
dc.relation.references	Fischer S, Dethlefsen SKlockgether J, Tümmler B.2020.Phenotypic and Genomic Comparison of the Two Most Common ExoU-Positive Pseudomonas aeruginosa Clones, PA14 and ST235. mSystems5:10.1128/msystems.01007- 20.https://doi.org/10.1128/msystems.01007-20
dc.relation.references	Correa A, Del Campo R, Perenguez M, et al. Dissemination of high-risk clones of extensively drug-resistant Pseudomonas aeruginosa in colombia. Antimicrob Agents Chemother. 2015;59(4):2421-2425. doi:10.1128/AAC.03926-14
dc.relation.references	Martinez E, Pérez JE, Buelvas F, Tovar C, Vanegas N, Stokes HW. Establishment and multi drug resistance evolution of ST235 Pseudomonas aeruginosa strains in the intensive care unit of a Colombian hospital. Res Microbiol [Internet]. 2014;165(10):852– 6. Disponible en: https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0923250814002137
dc.rights	l consultar y hacer uso de este recurso, está aceptando las condiciones de uso establecidas por los autores
dc.rights.license	Atribución-NoComercial-CompartirIgual 4.0 Internacional (CC BY-NC-SA 4.0)
dc.rights.uri	https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/
dc.subject.proposal	Pseudomonas aeruginosa
dc.subject.proposal	Secuenciación,
dc.subject.proposal	Epidemiología,
dc.subject.proposal	MLST
dc.subject.proposal	Complejos clonales
dc.title	Caracterización genómica de aislamientos de pseudomonas aeruginosa Multidrogorresistentes establecidos en un hospital de tercer nivel en Bogotá d.c., Colombia
dc.type	Trabajo de grado - Pregrado
dc.type.coar	http://purl.org/coar/resource_type/c_7a1f
dc.type.coarversion	http://purl.org/coar/version/c_970fb48d4fbd8a85
dc.type.content	Text
dc.type.driver	info:eu-repo/semantics/bachelorThesis
dc.type.redcol	http://purl.org/redcol/resource_type/TP
dc.type.version	info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dspace.entity.type	Publication